Die Mitgliedsorganisationen sind kantonal, islamisch und multiethnisch organisiert sowie über die ganze Schweiz verteilt. Gegenwärtig sind über 200 islamische Zentren in den 12 Mitgliedsorganisationen der FIDS registriert.
DAIGS

Dachverband der Albanisch-Islamischen Gemeinschaften in der Schweiz
Feldstrasse 14
4663 Aarburg (AG)
DIGO

Dachverband islamischer Gemeinden der Ostschweiz und des Fürstentums Liechtenstein
Rosenstrasse 45
9500 Wil
TISS

Türkisch islamische Stiftung Schweiz
Schwamendingenstrasse102
8050 Zürich
IGB

Islamische Gemeinschaft der Bosniaken
Postfach 924
4800 Zofingen
LMS

Ligue des Musulmans de Suisse
Avenue de la Confrérie 11
1008 Prilly
SIG

Schweizerische Islamische Glaubensgemeinschaft
Bahnstrasse 80
8105 Regensdorf
UNOM

Union Neuchateloise des Organisations Musulmanes
Avenue Léopold-Robert 109
2300 La Chaux-de-Fonds
UOMG

Union des organisations musulmanes de Genève
Case postale 6346
1211 Genève
UAMF

Union des Associations Musulmanes de Fribourg
Route de la Glâne 9
1700 Fribourg
UVAM

Union Vaudoise des Associations Musulmans
Case Postale 345
1000 Lausanne 16
VAM

Verband Aargauer Muslime
Hinterofenstrasse 31
5322 Koblenz
VIOZ

Vereinigung der Islamischen Organisationen in Zürich
Pfingstweidstrasse 16
8005 Zürich
YSMN

Young Swiss Muslim Network
8000 Zürich